Le médaka que vous connaissez peut-être le plus est le médaka à corps orange. En réalité, les médakas orange vendus en animalerie sont appelés « himedaka » et ont été élevés par l'homme à des fins ornementales ; ils n'existent pas à l'état sauvage. Les médakas naturels ont une couleur noirâtre qui les rend difficiles à repérer dans les rivières.

La disparition des médakas n'est pas uniquement due à la diminution de leurs habitats, mais aussi au problème des lâchers. L'analyse de l'ADN des quelques médakas survivants dans les rivières et étangs de Tokyo a révélé un mélange d'ADN de médakas et de médakas sauvages provenant de zones où leur présence est inappropriée. Ce phénomène peut être attribué au lâcher, par l'homme, de médakas sauvages et de médakas provenant d'autres milieux, alors qu'ils étaient élevés à la maison ou à l'école. Il est donc essentiel de ne pas relâcher ces animaux dans la nature à la légère et de toujours les garder de manière responsable jusqu'à la fin de leur vie.